基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA06G023230 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr06:6362141-6366983 (-) |
| 描述 | Similar to EXLB1: Expansin-like B1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026173 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g17030 |
类扩展蛋白 B1。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g38400 |
类膨胀素 A2。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g45960 |
类膨胀蛋白 A3。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g45970 |
类Expansin A1。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0496250 |
类扩展蛋白 B1。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0132200 |
类Expansin A1。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009653 | anatomical structure morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.169; 覆盖度=52.643; E 值=1.65e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009828 | plant-type cell wall loosening | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.13; 覆盖度=52.008; E 值=2.62e-99; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.13; 覆盖度=52.008; E 值=2.62e-99; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G17030 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.169; 覆盖度=52.643; E 值=1.65e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0132200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.15; 覆盖度=47.78; E 值=1.13e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |