基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA05G389450 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr05:96798956-96801159 (-) |
| 描述 | Similar to TADA: tRNA(adenine(34)) deaminase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021419 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g68720 |
在 tRNA-Arg(ACG) 中将腺苷脱氨为次黄嘌呤。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002100 | tRNA wobble adenosine to inosine editing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008251 | tRNA-specific adenosine deaminase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.223; 覆盖度=31.028; E 值=4.65e-36; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052717 | tRNA-specific adenosine-34 deaminase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G68720 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.879; 覆盖度=35.968; E 值=9.46e-73 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU00180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.223; 覆盖度=31.028; E 值=4.65e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | spa:M6_Spy0214 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.353; 覆盖度=33.597; E 值=9.42e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | spg:SpyM3_0153 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.353; 覆盖度=33.597; E 值=9.42e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sps:SPs0158 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.353; 覆盖度=33.597; E 值=9.42e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |