基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA05G141950 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr05:36893759-36896921 (+) |
| 描述 | Similar to RAB11D: Ras-related protein Rab11D (Lotus japonicus OX%3D34305) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_020134 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g18800 |
细胞内囊泡运输和蛋白质运输。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0551400 |
具有GTP酶活性。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006886 | intracellular protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.71; 覆盖度=81.992; E 值=4.34e-129; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015031 | protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=81.193; 覆盖度=83.525; E 值=6.61e-130; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042546 | cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=80.556; 覆盖度=82.759; E 值=1.15e-126; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.871; 覆盖度=83.142; E 值=8.54e-133; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=80.556; 覆盖度=82.759; E 值=1.15e-126; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0012505 | endomembrane system | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.71; 覆盖度=81.992; E 值=4.34e-129; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031901 | early endosome membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=80.556; 覆盖度=82.759; E 值=1.15e-126; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032588 | trans-Golgi network membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=80.556; 覆盖度=82.759; E 值=1.15e-126; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003924 | GTPase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.871; 覆盖度=83.142; E 值=8.54e-133; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005525 | GTP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=83.871; 覆盖度=83.142; E 值=8.54e-133; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G18800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=80.556; 覆盖度=82.759; E 值=1.15e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0551400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.71; 覆盖度=81.992; E 值=4.34e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |