基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G513400 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:129695055-129701806 (-) |
| 描述 | Similar to rhiE: Rhamnogalacturonate lyase (Dickeya dadantii (strain 3937) OX%3D198628) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_039182 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000272 | polysaccharide catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.199; 覆盖度=96.242; E 值=6.93e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005975 | carbohydrate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.81; 覆盖度=90.201; E 值=6.38e-21; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045490 | pectin catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=22.207; 覆盖度=96.107; E 值=9.06e-15; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=22.207; 覆盖度=96.107; E 值=9.06e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.81; 覆盖度=90.201; E 值=6.38e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016837 | carbon-oxygen lyase activity, acting on polysaccharides | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=22.207; 覆盖度=96.107; E 值=9.06e-15; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030246 | carbohydrate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.81; 覆盖度=90.201; E 值=6.38e-21; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0102210 | rhamnogalacturonan endolyase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.81; 覆盖度=90.201; E 值=6.38e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ang:An11g00390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=21.584; 覆盖度=67.785; E 值=4.04e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ani:ANIA_06395 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=22.207; 覆盖度=96.107; E 值=9.06e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ddd:Dda3937_01465 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.81; 覆盖度=90.201; E 值=6.38e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |