基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G478030 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:120718388-120720621 (-) |
| 描述 | Similar to At3g05500: REF/SRPP-like protein At3g05500 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_038922 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g05500 |
REF/SRPP 类蛋白 At3g05500。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2Y0H2 |
类REF/SRPP蛋白 OsI_017815。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0151300 |
REF/SRPP样蛋白 Os05g0151300/LOC_Os05g05940。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0019915 | lipid storage | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034389 | lipid droplet organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045927 | positive regulation of growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080186 | developmental vegetative growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902584 | positive regulation of response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005811 | lipid droplet | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G05500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.605; 覆盖度=93.886; E 值=7.4e-84 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0151300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.809; 覆盖度=102.62; E 值=8.04e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |