基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G474400 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:119800918-119802289 (-) |
| 描述 | Similar to VBF: F-box protein VBF (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_038884 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g56250 |
SCF(VBF) E3 泛素连接酶复合物的组分，在靶蛋白如 VIP1 及农杆菌 virE2 参与 T-DNA 转运至宿主细胞核后，介导其泛素化及随后蛋白酶体降解（可功能性替代农杆菌 VirF）。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g56240 |
F-盒蛋白 PP2-B13。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g09155 |
F-box 蛋白 PP2-B15。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g02240 |
F-box 蛋白 At2g02240。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g02250 |
推测的 F-盒蛋白 PP2-B2。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009617 | response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.538; 覆盖度=100.0; E 值=1.14e-85; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=36.232; 覆盖度=98.925; E 值=9.71e-55; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.906; 覆盖度=99.283; E 值=2.17e-55; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.538; 覆盖度=100.0; E 值=5.17e-86; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030246 | carbohydrate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.538; 覆盖度=100.0; E 值=5.17e-86; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G09155 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.5; 覆盖度=100.358; E 值=7.55e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G56240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.538; 覆盖度=100.0; E 值=1.14e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G56250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.538; 覆盖度=100.0; E 值=5.17e-86 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G02240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=36.232; 覆盖度=98.925; E 值=9.71e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G02250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.906; 覆盖度=99.283; E 值=2.17e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |