基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G142900 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:36950903-36952287 (+) |
| 描述 | Similar to At3g15890: PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g15890 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_028315 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g15890 |
PTI1样酪氨酸蛋白激酶 At3g15890。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g18810 |
推定的富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK6。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g34440 |
蛋白激酶 PERK5,富含脯氨酸的受体样蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g60800 |
受体激酶,与其他CIK(如CIK1、CIK2、CIK3、CIK5和CIK6)冗余作用,作为CLV1、CLV2/CRN和RPK2的共受体,并需要通过磷酸化介导CLAVATA家族肽(如CLV3)信号;该信号调控原韧皮部分化以及维持芽顶分生组织(SAM)和根顶分生组织(RAM)稳态,并在BRX和OPS下游发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g42960 |
可能的受体样蛋白激酶 At2g42960。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.667; 覆盖度=29.07; E 值=1.4e-107; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.797; 覆盖度=28.198; E 值=3.2e-88; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009620 | response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.797; 覆盖度=28.198; E 值=3.2e-88; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046777 | protein autophosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.797; 覆盖度=28.198; E 值=3.2e-88; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071456 | cellular response to hypoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.966; 覆盖度=28.101; E 值=5.09e-85; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.667; 覆盖度=29.07; E 值=1.4e-107; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.667; 覆盖度=29.07; E 值=1.4e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.667; 覆盖度=29.07; E 值=1.4e-107; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.797; 覆盖度=28.198; E 值=3.2e-88; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004715 | non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.667; 覆盖度=29.07; E 值=1.4e-107; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.667; 覆盖度=29.07; E 值=1.4e-107; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019901 | protein kinase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.966; 覆盖度=28.101; E 值=5.09e-85; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.797; 覆盖度=28.198; E 值=3.2e-88; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G68690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.966; 覆盖度=28.101; E 值=5.09e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G15890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.667; 覆盖度=29.07; E 值=1.4e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G24550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.797; 覆盖度=28.198; E 值=3.2e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |