基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G113050 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:29359990-29362723 (+) |
| 描述 | Similar to Os09g0533900: Endoglucanase 24 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035730 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g75680 |
内切葡聚糖酶10。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g19940 |
内切葡聚糖酶2。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g44560 |
内切葡聚糖酶14。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0533900 |
内切葡聚糖酶24。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0715300 |
内切葡聚糖酶18。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0030245 | cellulose catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.49; 覆盖度=88.702; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.49; 覆盖度=88.702; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.49; 覆盖度=88.702; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.476; 覆盖度=88.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.476; 覆盖度=88.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.895; 覆盖度=83.137; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008810 | cellulase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.49; 覆盖度=88.702; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030246 | carbohydrate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.921; 覆盖度=79.427; E 值=1.04e-134; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G19940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.242; 覆盖度=77.403; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G75680 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.476; 覆盖度=88.533; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G11050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.921; 覆盖度=79.427; E 值=1.04e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0715300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.895; 覆盖度=83.137; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0533900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.49; 覆盖度=88.702; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |