基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G058580 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:15614621-15617155 (-) |
| 描述 | Similar to At3g48380: Probable Ufm1-specific protease (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036275 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g48380 |
含硫蛋白酶,可识别并水解 UFM1(一种与多个靶蛋白结合的泛素样修饰蛋白)C 端的甘氨酸肽键。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0285500 |
硫醇蛋白酶,可识别并水解富铁蛋白1(ufm-1,一种与多种靶蛋白结合的泛素样修饰蛋白)C端甘氨酸的肽键。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.356; 覆盖度=110.082; E 值=6.41e-69; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006886 | intracellular protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006888 | endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006891 | intra-Golgi vesicle-mediated transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=5.25e-16; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.356; 覆盖度=110.082; E 值=6.41e-69; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030126 | COPI vesicle coat | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005198 | structural molecule activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071567 | deUFMylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.356; 覆盖度=110.082; E 值=6.41e-69; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G52360 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=2.35e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G15980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.664; 覆盖度=29.155; E 值=5.25e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G48380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.356; 覆盖度=110.082; E 值=6.41e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0143900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.794; 覆盖度=29.155; E 值=2.8e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0285500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.951; 覆盖度=72.752; E 值=4.96e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |