基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G019260 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:4828340-4829837 (-) |
| 描述 | Similar to ADF6: Actin-depolymerizing factor 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036874 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0628100 |
肌动蛋白解聚蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0780400 |
肌动蛋白解聚蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0030042 | actin filament depolymerization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.611; 覆盖度=98.63; E 值=1.25e-78; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.611; 覆盖度=98.63; E 值=1.25e-78; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015629 | actin cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.611; 覆盖度=98.63; E 值=1.25e-78; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003779 | actin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=79.452; 覆盖度=100.0; E 值=7.54e-78; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051015 | actin filament binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.611; 覆盖度=98.63; E 值=1.25e-78; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G01750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=63.504; 覆盖度=93.836; E 值=5.9e-68 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G31200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.611; 覆盖度=98.63; E 值=1.25e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0780400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=70.548; 覆盖度=100.0; E 值=2.28e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0628100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.603; 覆盖度=100.0; E 值=5.03e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | vvi:100232871 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=79.452; 覆盖度=100.0; E 值=7.54e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |