基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G017490 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:4354933-4355903 (-) |
| 描述 | Similar to AUX22D: Auxin-induced protein 22D (Vigna radiata var. radiata OX%3D3916) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036922 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g04240 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 |
A genetic framework for the control of cell division and differentiation in the root meristem.2008 · DOI: 10.1126/science.1164147 The rate of cell differentiation controls the Arabidopsis root meristem growth phase.2010 · DOI: 10.1016/j.cub.2010.05.035 Spatio-temporal sequence of cross-regulatory events in root meristem growth.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1014716108
|
At5g43700 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=100.0; E 值=9.39e-73; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=100.0; E 值=9.39e-73; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.459; 覆盖度=99.451; E 值=1.2e-67; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=100.0; E 值=9.39e-73; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.538; 覆盖度=100.0; E 值=9.39e-73; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.459; 覆盖度=99.451; E 值=1.2e-67; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.459; 覆盖度=99.451; E 值=1.2e-67; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.459; 覆盖度=99.451; E 值=1.2e-67; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G04240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.459; 覆盖度=99.451; E 值=1.2e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | vra:106757071 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.545; 覆盖度=104.945; E 值=2.05e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |