基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G603000 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:153182426-153186514 (-) |
| 描述 | Similar to MTOPVIB: Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011584 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g60460 |
拓扑异构酶6复合物的一个组分,专门用于减数分裂重组。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042138 | meiotic DNA double-strand break formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048235 | pollen sperm cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048314 | embryo sac morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0065003 | protein-containing complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000793 | condensed chromosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003918 | DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=TAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030674 | protein-macromolecule adaptor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G60460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.093; 覆盖度=103.812; E 值=9.38e-101 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |