基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G565920 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:143612302-143612628 (-) |
| 描述 | Similar to BPC1: Protein BASIC PENTACYSTEINE1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011116 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 7 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g01930 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件特异性结合。 | |
At1g14685 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g68120 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0114500 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
Os10g0115200 |
转录调节因子,与发育过程中涉及的基因调控序列中存在的富含 GA 的元件(GAGA 重复序列)特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009723 | response to ethylene | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050793 | regulation of developmental process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080157 | regulation of plant-type cell wall organization or biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901002 | positive regulation of response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000987 | cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001222 | transcription corepressor binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990837 | sequence-specific double-stranded DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G14685 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.014; 覆盖度=71.498; E 值=2.69e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G68120 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.279; 覆盖度=71.014; E 值=4.63e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G01930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.115; 覆盖度=73.671; E 值=2.47e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0114500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.333; 覆盖度=36.232; E 值=7.62e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0115200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=69.333; 覆盖度=36.232; E 值=7.62e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4347983 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=69.333; 覆盖度=36.232; E 值=7.62e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:9268674 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=69.333; 覆盖度=36.232; E 值=7.62e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |