基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G545840 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:137721968-137723903 (-) |
| 描述 | Similar to KPHMT2: 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase 2%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_010736 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g46110 |
催化可逆反应，将5,10-亚甲基四氢叶酸的羟甲基转移到α-酮异戊酸生成酮基潘酸。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g61530 |
催化可逆反应，将5,10-亚甲基四氢叶酸的羟甲基转移到α-酮异戊酸生成酮基潘酸。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0225400 |
催化可逆反应，将5,10-亚甲基四氢叶酸的羟甲基转移到α-酮异戊酸生成酮基潘酸。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0225500 |
催化可逆反应，将5,10-亚甲基四氢叶酸的羟甲基转移到α-酮异戊酸生成酮基潘酸。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0015940 | pantothenate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.627; 覆盖度=41.941; E 值=2.45e-85; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000287 | magnesium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003864 | 3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050897 | cobalt ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G46110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=82.716; 覆盖度=50.704; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G61530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.707; 覆盖度=51.33; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | chy:CHY_2377 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.627; 覆盖度=41.941; E 值=2.45e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0225400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=78.614; 覆盖度=51.956; E 值=1.28e-179 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:107275880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=69.427; 覆盖度=49.139; E 值=1.35e-143 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |