基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G522080 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:131002908-131004265 (+) |
| 描述 | Similar to RPL11: 60S ribosomal protein L11 (Medicago sativa OX%3D3879) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009759 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 17 条 GO 注释和 7 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g42740 |
核糖体的组分,核糖核蛋白复合体的一部分,负责细胞内蛋白质的合成。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: P42794 |
核糖体的组分,核糖核蛋白复合体的一部分,负责细胞内蛋白质的合成。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2YDY2 |
核糖体的组分,核糖核蛋白复合体的一部分,负责细胞内蛋白质的合成。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0207300 |
核糖体的组分,核糖核蛋白复合体的一部分,负责细胞内蛋白质的合成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.222; 覆盖度=98.901; E 值=5.24e-129; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.222; 覆盖度=98.901; E 值=5.24e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.222; 覆盖度=98.901; E 值=5.24e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005840 | ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.222; 覆盖度=98.901; E 值=5.24e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=93.407; 覆盖度=100.0; E 值=3.56e-126; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015934 | large ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=93.407; 覆盖度=100.0; E 值=3.56e-126; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022625 | cytosolic large ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022626 | cytosolic ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=93.407; 覆盖度=100.0; E 值=3.56e-126; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.222; 覆盖度=98.901; E 值=5.24e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.222; 覆盖度=98.901; E 值=5.24e-129; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019843 | rRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=97.222; 覆盖度=98.901; E 值=5.24e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G42740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=93.956; 覆盖度=100.0; E 值=8.26e-127 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G58700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=93.407; 覆盖度=100.0; E 值=3.56e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G18730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=93.407; 覆盖度=100.0; E 值=3.56e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G45775 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=93.407; 覆盖度=100.0; E 值=3.56e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0207300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=93.82; 覆盖度=97.802; E 值=1.48e-124 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0550000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=93.82; 覆盖度=97.802; E 值=1.48e-124 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4341262 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=93.82; 覆盖度=97.802; E 值=1.48e-124 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |