基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G519540 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:130346430-130348145 (+) |
| 描述 | Similar to OsI_14861: Senescence-specific cysteine protease SAG39 (Oryza sativa subsp. indica OX%3D39946) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_010326 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g45890 |
半胱氨酸蛋白酶，可能在细胞凋亡、重金属解毒及超敏反应期间参与发育性衰老相关的细胞死亡。 |
Identification of a promoter region responsible for the senescence-specific expression of SAG12.1999 · DOI: 10.1023/a:1006342412688 HDA6 is required for jasmonate response, senescence and flowering in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1093/jxb/erm300 Natural developmental variations in leaf and plant senescence in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2008.00108.x
|
At3g48340 |
参与发育程序性细胞死亡的最后阶段和新细胞的插入。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0206300 |
半胱氨酸蛋白酶，可能在细胞凋亡、重金属解毒及超敏反应期间参与发育性衰老相关的细胞死亡。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2XQE8 |
半胱氨酸蛋白酶，可能在细胞凋亡、重金属解毒及超敏反应期间参与发育性衰老相关的细胞死亡。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009723 | response to ethylene | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009739 | response to gibberellin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010150 | leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010623 | programmed cell death involved in cell development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051603 | proteolysis involved in protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.4e-141; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005615 | extracellular space | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.4e-141; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005764 | lysosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.4e-141; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005788 | endoplasmic reticulum lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.043; 覆盖度=101.76; E 值=1.92e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010282 | senescence-associated vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031410 | cytoplasmic vesicle | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.609; 覆盖度=90.029; E 值=4.7e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004197 | cysteine-type endopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.4e-141; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008234 | cysteine-type peptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.27e-141; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | osa:107276017 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.812; 覆盖度=101.173; E 值=1.4e-141 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rcu:8278243 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.609; 覆盖度=90.029; E 值=4.7e-127 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |