基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G518510 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:130106199-130111430 (+) |
| 描述 | Similar to PDC1: Pyruvate decarboxylase 1 (Pisum sativum OX%3D3888) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010311 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g01320 |
丙酮酸脱羧酶4。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0293500 |
丙酮酸脱羧酶 2。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2XFI3 |
丙酮酸脱羧酶 2。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2Y5L9 |
丙酮酸脱羧酶1。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000949 | aromatic amino acid family catabolic process to alcohol via Ehrlich pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.092; 覆盖度=94.825; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006950 | response to stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.092; 覆盖度=94.825; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0036293 | response to decreased oxygen levels | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.092; 覆盖度=94.825; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.092; 覆盖度=94.825; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000287 | magnesium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.092; 覆盖度=94.825; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004737 | pyruvate decarboxylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.092; 覆盖度=94.825; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030976 | thiamine pyrophosphate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.092; 覆盖度=94.825; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os03g0293500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=79.31; 覆盖度=96.828; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0469600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.269; 覆盖度=94.491; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |