基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G508620 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:127516953-127521133 (+) |
| 描述 | Similar to RC1_1518: Putative pre-16S rRNA nuclease (Rhodospirillum centenum (strain ATCC 51521 / SW) OX%3D414684) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026452 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000967 | rRNA 5'-end processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.065; 覆盖度=52.941; E 值=1.16e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.065; 覆盖度=52.941; E 值=1.16e-10; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004518 | nuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.065; 覆盖度=52.941; E 值=1.16e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016788 | hydrolase activity, acting on ester bonds | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.065; 覆盖度=52.941; E 值=1.16e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | chy:CHY_0542 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.394; 覆盖度=49.135; E 值=2.99e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | csc:Csac_1776 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=32.215; 覆盖度=51.557; E 值=4.27e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rce:RC1_1518 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.065; 覆盖度=52.941; E 值=1.16e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rcp:RCAP_rcc02318 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.646; 覆盖度=54.671; E 值=2.88e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | tpd:Teth39_1054 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.435; 覆盖度=47.751; E 值=2.84e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |