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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA03G487330
当前查询版本TK1151
位置Chr03:121969309-121971855 (-)
描述Similar to PUB4: U-box domain-containing protein 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_009977 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g67340 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At3g54850 与特定的 E2 泛素结合酶一起发挥 E3 泛素连接酶的作用。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2ZLU6 与防御相关的蛋白,可负向调控程序性细胞死亡。 暂无已核实直接文献
Os12g0570000 E3 泛素蛋白连接酶,负向调节程序性细胞死亡和抗病性。
Os06g0102700 在体外具有 E3 泛素蛋白连接酶。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031648protein destabilization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.23; 覆盖度=61.538; E 值=3.99e-59; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0034614cellular response to reactive oxygen species生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048364root development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048658anther wall tapetum development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0051865protein autoubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.23; 覆盖度=61.538; E 值=3.99e-59; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090333regulation of stomatal closure生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.237; 覆盖度=60.499; E 值=2.57e-58; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1904821chloroplast disassembly生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:2000022regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.23; 覆盖度=61.538; E 值=3.99e-59; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.23; 覆盖度=61.538; E 值=3.99e-59; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G23030KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.237; 覆盖度=60.499; E 值=2.57e-58UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G71020KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.23; 覆盖度=61.538; E 值=3.99e-59UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G23140KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.5; 覆盖度=83.16; E 值=4.75e-75UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G54790KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.735; 覆盖度=60.499; E 值=3.35e-61UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G67340KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.013; 覆盖度=62.786; E 值=1.35e-69UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release