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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA03G481970
当前查询版本TK1151
位置Chr03:120545190-120545738 (+)
描述Similar to LSH10: Protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_009910 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g42610 可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献
At1g78815 可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XVI8 可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献
Os04g0516200 可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献
Os10g0478000 可能的转录调控因子,通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009299mRNA transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.39; 覆盖度=90.608; E 值=5.91e-83; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009416response to light stimulus生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.39; 覆盖度=90.608; E 值=5.91e-83; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090698post-embryonic plant morphogenesis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.39; 覆盖度=90.608; E 值=5.91e-83; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.39; 覆盖度=90.608; E 值=5.91e-83; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=67.606; 覆盖度=78.453; E 值=2.53e-70; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.39; 覆盖度=90.608; E 值=5.91e-83; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G07090KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=69.63; 覆盖度=74.586; E 值=1.77e-71UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G16910KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=67.606; 覆盖度=78.453; E 值=2.53e-70UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G78815KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.0; 覆盖度=69.061; E 值=3.02e-71UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G42610KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.39; 覆盖度=90.608; E 值=5.91e-83UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G58500KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.161; 覆盖度=85.635; E 值=9.71e-70UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release