基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G479910 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:120011618-120015122 (+) |
| 描述 | Similar to UBC38: Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 38 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009881 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.092; 覆盖度=60.907; E 值=1.76e-117; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.248; 覆盖度=66.091; E 值=7.39e-115; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.092; 覆盖度=60.907; E 值=1.76e-117; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061631 | ubiquitin conjugating enzyme activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.092; 覆盖度=60.907; E 值=1.76e-117; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G53023 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.815; 覆盖度=65.443; E 值=1.27e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G53025 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.248; 覆盖度=66.091; E 值=7.39e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G16920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=55.235; 覆盖度=59.827; E 值=8.17e-98 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G15355 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=60.385; 覆盖度=56.156; E 值=1.24e-111 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |