基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G409440 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:101794971-101798437 (+) |
| 描述 | Similar to pds5b-b: Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B-B (Xenopus laevis OX%3D8355) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009211 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g80810 |
Cohesin 辅因子在减数分裂过程中可有可无,但在通过同源重组(HR)修复 DNA 中可能起重要作用,可能是通过帮助 SMC5/SMC6 复合物。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g31880 |
Cohesin 辅因子在减数分裂过程中可有可无,但在通过同源重组(HR)修复 DNA 中可能起重要作用,可能是通过帮助 SMC5/SMC6 复合物。 | |
At1g15940 |
Cohesin 辅因子在减数分裂过程中可有可无,但在通过同源重组(HR)修复 DNA 中可能起重要作用,可能是通过帮助 SMC5/SMC6 复合物。 | |
At5g47690 |
Cohesin 辅因子在减数分裂过程中可有可无,但在通过同源重组(HR)修复 DNA 中可能起重要作用,可能是通过帮助 SMC5/SMC6 复合物。 | |
At1g77600 |
Cohesin 辅因子在减数分裂过程中可有可无,但在通过同源重组(HR)修复 DNA 中可能起重要作用,可能是通过帮助 SMC5/SMC6 复合物。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006310 | DNA recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007064 | mitotic sister chromatid cohesion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009556 | microsporogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.398; 覆盖度=45.438; E 值=2.95e-73; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010468 | regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.398; 覆盖度=45.438; E 值=2.95e-73; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035825 | homologous recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000785 | chromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005874 | microtubule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.398; 覆盖度=45.438; E 值=2.95e-73; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.387; 覆盖度=45.255; E 值=2.23e-66; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.398; 覆盖度=45.438; E 值=2.95e-73; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140670 | cohesin unloader activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G15940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.387; 覆盖度=45.255; E 值=2.23e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G80810 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=45.938; 覆盖度=58.394; E 值=8.86e-83 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G31880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.398; 覆盖度=45.438; E 值=2.95e-73 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |