基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G041120 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:10861370-10864334 (-) |
| 描述 | Similar to UPTG2: Probable UDP-arabinopyranose mutase 2 (Solanum tuberosum OX%3D4113) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006487 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0599800 |
UDP-L-阿拉伯糖变位酶参与细胞壁非纤维素多糖的生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009101 | glycoprotein biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030244 | cellulose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033356 | UDP-L-arabinose metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071669 | plant-type cell wall organization or biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016866 | intramolecular transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.393; 覆盖度=95.455; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052691 | UDP-arabinopyranose mutase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.608; 覆盖度=98.58; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os03g0599800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=88.393; 覆盖度=95.455; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:542592 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=85.795; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |