基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G007040 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:1691704-1694184 (+) |
| 描述 | Similar to Os09g0505700: Ribulose-phosphate 3-epimerase%2C cytoplasmic isoform (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006050 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0505700 |
催化 D-核酮糖 5-磷酸与 D-木酮糖 5-磷酸之间的可逆表异构化反应。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005975 | carbohydrate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.758; 覆盖度=80.782; E 值=4.55e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006098 | pentose-phosphate shunt | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.893; 覆盖度=85.016; E 值=3.76e-72; UniProt GO evidence=IMP:SGD | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009052 | pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.758; 覆盖度=80.782; E 值=4.55e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.244; 覆盖度=82.736; E 值=4.59e-73; UniProt GO evidence=HDA:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.758; 覆盖度=80.782; E 值=4.55e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004750 | D-ribulose-phosphate 3-epimerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.758; 覆盖度=80.782; E 值=4.55e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.758; 覆盖度=80.782; E 值=4.55e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ago:AGOS_AFL208C | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.899; 覆盖度=84.039; E 值=8.1e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cgr:2890792 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.627; 覆盖度=85.668; E 值=6.62e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0505700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.758; 覆盖度=80.782; E 值=4.55e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sce:YJL121C | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.893; 覆盖度=85.016; E 值=3.76e-72 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | spo:2543174 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.244; 覆盖度=82.736; E 值=4.59e-73 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |