基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G610630 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:157533606-157535515 (+) |
| 描述 | Similar to AFP1: Ninja-family protein AFP1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011401 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g13740 |
通过泛素介导的 ABI5/DPBF1 蛋白水解作用,在发芽过程中充当脱落酸 反应的负调节剂。 | |
At3g29575 |
作为脱落酸(ABA)反应和胁迫反应的负调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g69260 |
在萌发过程中通过对 ABI5/DPBF1 的泛素介导蛋白水解,作为脱落酸(ABA)反应的负调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0419100 |
通过负向调控AGO18,作为水稻条纹病毒(RSV)茉莉酸抗病毒途径的抑制因子。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.496; 覆盖度=107.08; E 值=4.65e-64; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.496; 覆盖度=107.08; E 值=4.65e-64; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.807; 覆盖度=99.41; E 值=3.08e-67; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009738 | abscisic acid-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.807; 覆盖度=99.41; E 值=3.08e-67; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.807; 覆盖度=99.41; E 值=3.08e-67; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.807; 覆盖度=99.41; E 值=3.08e-67; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G13740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.496; 覆盖度=107.08; E 值=4.65e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G69260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=44.807; 覆盖度=99.41; E 值=3.08e-67 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G29575 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.098; 覆盖度=87.611; E 值=2.52e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:100280792 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.556; 覆盖度=92.92; E 值=1.15e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |