基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G605760 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:156273902-156275954 (+) |
| 描述 | Similar to Os04g0510400: DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 13 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014601 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g16840 |
DEAD-box ATP 依赖的 RNA 解旋酶 13。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XVF7 |
DEAD-box ATP 依赖的 RNA 解旋酶 13。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0510400 |
DEAD-box ATP 依赖的 RNA 解旋酶 13。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006364 | rRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.559; 覆盖度=69.586; E 值=1.93e-110; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.344; 覆盖度=77.859; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031425 | chloroplast RNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.344; 覆盖度=77.859; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.344; 覆盖度=77.859; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.319; 覆盖度=81.144; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.319; 覆盖度=81.144; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003724 | RNA helicase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.319; 覆盖度=81.144; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.319; 覆盖度=81.144; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016887 | ATP hydrolysis activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.319; 覆盖度=81.144; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G16840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.344; 覆盖度=77.859; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cnb:CNBL0260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.559; 覆盖度=69.586; E 值=1.93e-110 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ddi:DDB_G0281841 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.782; 覆盖度=75.912; E 值=1.59e-133 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0510400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.319; 覆盖度=81.144; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |