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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA02G572910
当前查询版本TK1151
位置Chr02:147979337-147979891 (+)
描述Similar to PCMP-H27: Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g35130%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_009678 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g35130 含五十二氨基酸重复序列的蛋白At4g35130,叶绿体定位。 暂无已核实直接文献
At3g05340 含五肽重复序列蛋白 At3g05340。 暂无已核实直接文献
At1g03540 含五肽重复的蛋白 At1g03540。 暂无已核实直接文献
At1g11290 参与叶绿体中多个位点的RNA编辑事件。
At1g56570 推测含五重复肽序列蛋白At1g56570。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.908; 覆盖度=95.369; E 值=9.96e-158; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.612; 覆盖度=91.99; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010087phloem or xylem histogenesis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.908; 覆盖度=95.369; E 值=9.96e-158; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010305leaf vascular tissue pattern formation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.908; 覆盖度=95.369; E 值=9.96e-158; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010588cotyledon vascular tissue pattern formation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.908; 覆盖度=95.369; E 值=9.96e-158; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016556mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.246; 覆盖度=91.615; E 值=5.27e-156; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048366leaf development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.908; 覆盖度=95.369; E 值=9.96e-158; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900865chloroplast RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.908; 覆盖度=95.369; E 值=9.96e-158; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.612; 覆盖度=91.99; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.612; 覆盖度=91.99; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.612; 覆盖度=91.99; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.246; 覆盖度=91.615; E 值=5.27e-156; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004519endonuclease activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.246; 覆盖度=91.615; E 值=5.27e-156; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.612; 覆盖度=91.99; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G11290KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.246; 覆盖度=91.615; E 值=5.27e-156UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G18750KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.908; 覆盖度=95.369; E 值=9.96e-158UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G35130KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.612; 覆盖度=91.99; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release