基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G550370 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:141992537-141997713 (-) |
| 描述 | Similar to VITISV_037692: Arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ%2C chloroplastic (Vitis vinifera OX%3D29760) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012607 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g37500 |
催化两种涉及精氨酸生物合成循环版本的活性:由谷氨酸和乙酰辅酶A合成乙酰谷氨酸,以及通过乙酰鸟氨酸和谷氨酸之间的转乙酰作用合成鸟氨酸。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g54580 |
参与线粒体 RNA 的 C 到 U 编辑。 | |
At5g06210 |
可能的RNA结合蛋白,可能参与盐胁迫和氧化胁迫耐受。 | |
At3g20930 |
参与叶绿体 RNA 的 C 到 U 编辑。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0730800 |
参与叶绿体 RNA 的 C 到 U 编辑。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006526 | L-arginine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.102; 覆盖度=76.228; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006592 | ornithine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.768; 覆盖度=70.998; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.768; 覆盖度=70.998; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.768; 覆盖度=70.998; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.102; 覆盖度=76.228; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.768; 覆盖度=70.998; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004042 | L-glutamate N-acetyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.102; 覆盖度=76.228; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004358 | L-glutamate N-acetyltransferase activity, acting on acetyl-L-ornithine as donor | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.102; 覆盖度=76.228; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G37500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.768; 覆盖度=70.998; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rcu:8269377 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=74.831; 覆盖度=70.523; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sbi:8081475 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=72.889; 覆盖度=71.315; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |