基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G535530 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:138097073-138098479 (-) |
| 描述 | Similar to CCH: Copper transport protein CCH (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012848 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g56240 |
参与铜的稳态调节。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g66240 |
通过在营养生长期赋予对铜过量和亚临床铜缺乏的耐受性,在铜稳态中起重要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g27690 |
重金属结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g02600 |
需要在种子萌发后维持根分生组织。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006825 | copper ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006878 | intracellular copper ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046686 | response to cadmium ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.373; 覆盖度=40.136; E 值=1.23e-12; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.079; 覆盖度=42.857; E 值=2.33e-25; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.079; 覆盖度=42.857; E 值=2.33e-25; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.079; 覆盖度=42.857; E 值=2.33e-25; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0099503 | secretory vesicle | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.079; 覆盖度=42.857; E 值=2.33e-25; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016531 | copper chaperone activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019904 | protein domain specific binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=IPI:CAFA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G66240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.079; 覆盖度=42.857; E 值=2.33e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G56240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.414; 覆盖度=39.456; E 值=3.13e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G56891 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.522; 覆盖度=62.585; E 值=8.58e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G27690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.373; 覆盖度=40.136; E 值=1.23e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |