基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G499610 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:128031282-128034340 (-) |
| 描述 | Similar to KDSA: 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase (Pisum sativum OX%3D3888) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013367 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g79500 |
催化D-阿拉伯糖5-磷酸与磷酸烯醇丙酮酸的立体特异性缩合,生成3-脱氧-D-甘露-辛酮糖酸8-磷酸(KDO-8-phosphate)和无机磷酸。 | |
At1g16340 |
催化D-阿拉伯糖5-磷酸与磷酸烯醇丙酮酸的立体特异性缩合,生成3-脱氧-D-甘露-辛酮糖酸8-磷酸(KDO-8-phosphate)和无机磷酸。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009860 | pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=86.851; 覆盖度=99.655; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010306 | rhamnogalacturonan II biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=86.851; 覆盖度=99.655; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046364 | monosaccharide biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=86.851; 覆盖度=99.655; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048868 | pollen tube development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=86.851; 覆盖度=99.655; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.197; 覆盖度=99.655; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=86.851; 覆盖度=99.655; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008676 | 3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=87.197; 覆盖度=99.655; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G16340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=85.069; 覆盖度=99.31; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G79500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=86.851; 覆盖度=99.655; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pca:Pcar_1944 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.409; 覆盖度=91.034; E 值=3.53e-96 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pna:Pnap_1184 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.648; 覆盖度=94.138; E 值=1.63e-95 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |