基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G473570 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:120841415-120844359 (-) |
| 描述 | Similar to MAN5: Mannan endo-1%2C4-beta-mannosidase 5 (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_007715 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g66460 |
对于珠孔胚乳的松动和发芽种子中种皮的破裂都是必需的。 | |
At3g10890 |
复合甘露聚糖内切-1,4-β-甘露糖苷酶 3。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0663300 |
甘露聚糖内切-1,4-β-甘露糖苷酶1。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0766900 |
推定甘露聚糖内切1,4-β-甘露糖苷酶9。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000272 | polysaccharide catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.16; 覆盖度=86.17; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.16; 覆盖度=86.17; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016985 | mannan endo-1,4-beta-mannosidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.16; 覆盖度=86.17; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os01g0663300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.922; 覆盖度=81.915; E 值=1.06e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:544170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.16; 覆盖度=86.17; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:544199 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.0; 覆盖度=85.106; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |