基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G461030 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:117471101-117475223 (+) |
| 描述 | Similar to PSY1: Bifunctional 15-cis-phytoene synthase%2C chromoplastic (Capsicum annuum OX%3D4072) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_024809 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g17230 |
催化前茄萜二磷酸到茄萜的反应。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0729000 |
催化香叶基香叶基二磷酸转化为八氢番茄红素。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016117 | carotenoid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.223; 覆盖度=99.764; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=73.077; 覆盖度=98.345; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009575 | chromoplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.223; 覆盖度=99.764; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010287 | plastoglobule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=75.25; 覆盖度=94.563; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031969 | chloroplast membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=75.25; 覆盖度=94.563; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004311 | geranylgeranyl diphosphate synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.223; 覆盖度=99.764; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046905 | 15-cis-phytoene synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.223; 覆盖度=99.764; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051996 | squalene synthase [NAD(P)H] activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.223; 覆盖度=99.764; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G17230 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=75.25; 覆盖度=94.563; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cann:107868281 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.223; 覆盖度=99.764; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:543988 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=73.077; 覆盖度=98.345; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |