基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G441270 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:112173655-112174698 (-) |
| 描述 | Similar to RUB2: Ubiquitin-NEDD8-like protein RUB2 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014290 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g31340 |
泛素可以共价地附着在另一种蛋白质上,也可以以游离(非锚定)形式存在。 | |
At2g35635 |
泛素可以共价地附着在另一种蛋白质上,也可以以游离(非锚定)形式存在。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0420800 |
泛素可以共价地附着在另一种蛋白质上,也可以以游离(非锚定)形式存在。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0650100 |
泛素可以共价地附着在另一种蛋白质上,也可以以游离(非锚定)形式存在。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009693 | ethylene biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=100.0; 覆盖度=98.701; E 值=9.26e-106; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=100.0; 覆盖度=98.701; E 值=9.26e-106; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=99.346; 覆盖度=99.351; E 值=5.44e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019941 | modification-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=99.346; 覆盖度=99.351; E 值=5.44e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045116 | protein neddylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=100.0; 覆盖度=98.701; E 值=9.26e-106; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=99.346; 覆盖度=99.351; E 值=5.44e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=100.0; 覆盖度=98.701; E 值=9.26e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=100.0; 覆盖度=98.701; E 值=9.26e-106; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022626 | cytosolic ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=99.346; 覆盖度=99.351; E 值=5.44e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=99.346; 覆盖度=99.351; E 值=5.44e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=99.346; 覆盖度=99.351; E 值=5.44e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031386 | protein tag activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=99.346; 覆盖度=99.351; E 值=5.44e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G31340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=100.0; 覆盖度=98.701; E 值=9.26e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0420800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=100.0; 覆盖度=98.701; E 值=8.35e-106 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |