基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G209120 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:53367176-53376434 (-) |
| 描述 | Similar to TIC236: Protein TIC236%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_015816 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g25660 |
内叶绿体膜转运复合体(TIC)的一部分,该复合体与外叶绿体膜转运复合体(TOC)相关联,形成一个超复合体,参与蛋白前体进入叶绿体基质。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0179400 |
叶绿体内膜转位复合物(TIC)的组成部分,与叶绿体外膜转位复合物(TOC)结合,并形成参与蛋白前体进入叶绿体基质的超复合体(通过相似性推测)。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009306 | protein secretion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.509; 覆盖度=78.133; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009660 | amyloplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.783; 覆盖度=79.115; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.509; 覆盖度=78.133; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009501 | amyloplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.783; 覆盖度=79.115; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.509; 覆盖度=78.133; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009706 | chloroplast inner membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.509; 覆盖度=78.133; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031972 | chloroplast intermembrane space | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.509; 覆盖度=78.133; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G25660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.509; 覆盖度=78.133; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0179400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.783; 覆盖度=79.115; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4323878 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.783; 覆盖度=79.115; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |