基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA02G106070 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr02:27790293-27794146 (-) |
| 描述 | Similar to RUS6: Protein root UVB sensitive 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016741 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g49820 |
对正常胚胎发育必需。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g45890 |
参与根 UV-B 传感通路并防止对极低注量率 UV-B 过敏。 |
Role of root UV-B sensing in Arabidopsis early seedling development.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809942106
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009926 | auxin polar transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.833; 覆盖度=82.157; E 值=6.85e-48; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010224 | response to UV-B | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.833; 覆盖度=82.157; E 值=6.85e-48; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.886; 覆盖度=96.471; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.833; 覆盖度=82.157; E 值=6.85e-48; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.833; 覆盖度=82.157; E 值=6.85e-48; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.579; 覆盖度=63.333; E 值=8.32e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G31190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.833; 覆盖度=82.157; E 值=6.85e-48 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G49820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.886; 覆盖度=96.471; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:233913 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.579; 覆盖度=63.333; E 值=8.32e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pon:100173090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.793; 覆盖度=63.333; E 值=3.01e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rno:361654 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.412; 覆盖度=63.333; E 值=1.71e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |