RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDTkA02G056570
当前查询版本TK1151
位置Chr02:14750949-14752532 (-)
描述Similar to PCMP-E29: Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g21470 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017307 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g49142 推定含五重复肽的蛋白质 At3g49142。 暂无已核实直接文献
At1g11290 参与叶绿体中多个位点的RNA编辑事件。
Pentatricopeptide repeat proteins with the DYW motif have distinct molecular functions in RNA editing and RNA cleavage in Arabidopsis chloroplasts.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.064667
At2g20540 含五螺旋肽重复的蛋白 At2g20540。 暂无已核实直接文献
At5g56310 含五肽重复蛋白 At5g56310。 暂无已核实直接文献
At3g11460 参与线粒体 RNA 的 C 到 U 编辑。
MEF10 is required for RNA editing at nad2-842 in mitochondria of Arabidopsis thaliana and interacts with MORF8.2013 · DOI: 10.1007/s11103-012-0003-2

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.56; 覆盖度=93.223; E 值=9.42e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.817; 覆盖度=92.308; E 值=6.55e-165; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016556mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.56; 覆盖度=93.223; E 值=9.42e-103; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900865chloroplast RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.56; 覆盖度=93.223; E 值=9.42e-103; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005773vacuole细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.56; 覆盖度=93.223; E 值=9.42e-103; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.817; 覆盖度=92.308; E 值=6.55e-165; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.817; 覆盖度=92.308; E 值=6.55e-165; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.557; 覆盖度=94.689; E 值=1.8e-114; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G45350KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.56; 覆盖度=93.223; E 值=9.42e-103UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G21470KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.817; 覆盖度=92.308; E 值=6.55e-165UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G29230KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.557; 覆盖度=94.689; E 值=1.8e-114UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release