基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G614600 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:155005163-155009962 (+) |
| 描述 | Similar to NEK6: Serine/threonine-protein kinase Nek6 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000392 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g20860 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g12200 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g44200 |
参与下胚轴和根部的表皮细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0590800 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0440800 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0864700 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2ZMH2 |
可能参与植物发育过程。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006468 | protein phosphorylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.254; 覆盖度=59.049; E 值=3.56e-158; UniProt GO evidence=IDA:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.254; 覆盖度=59.049; E 值=3.56e-158; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010366 | negative regulation of ethylene biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.254; 覆盖度=59.049; E 值=3.56e-158; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043622 | cortical microtubule organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.177; 覆盖度=103.473; E 值=9.02e-168; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.254; 覆盖度=59.049; E 值=3.56e-158; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.177; 覆盖度=103.473; E 值=9.02e-168; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.102; 覆盖度=107.861; E 值=7.76e-152; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055028 | cortical microtubule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.177; 覆盖度=103.473; E 值=9.02e-168; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.177; 覆盖度=103.473; E 值=9.02e-168; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.177; 覆盖度=103.473; E 值=9.02e-168; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.177; 覆盖度=103.473; E 值=9.02e-168; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G12200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.102; 覆盖度=107.861; E 值=7.76e-152 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G20860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.254; 覆盖度=59.049; E 值=3.56e-158 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0590800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.177; 覆盖度=103.473; E 值=9.02e-168 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0440800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.646; 覆盖度=54.296; E 值=8.65e-139 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4338922 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=64.646; 覆盖度=54.296; E 值=8.65e-139 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |