基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G593390 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:149381611-149383178 (-) |
| 描述 | Similar to GSVIVT00023967001: Peroxidase 4 (Vitis vinifera OX%3D29760) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000692 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g58390 |
去除 H(2)O(2),氧化有毒还原剂,木质素的生物合成与降解,角质化,生长素分解,对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g58400 |
去除 H(2)O(2),氧化有毒还原剂,木质素的生物合成与降解,角质化,生长素分解,对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g05340 |
去除 H(2)O(2),氧化有毒还原剂,木质素的生物合成与降解,角质化,生长素分解,对如创伤、病原体侵染和氧化应激等环境胁迫的响应。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006979 | response to oxidative stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.421; 覆盖度=99.691; E 值=4.75e-162; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009809 | lignin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.449; 覆盖度=92.901; E 值=2.26e-146; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010089 | xylem development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.449; 覆盖度=92.901; E 值=2.26e-146; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.273; 覆盖度=95.988; E 值=1.15e-148; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042744 | hydrogen peroxide catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.421; 覆盖度=99.691; E 值=4.75e-162; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901430 | positive regulation of syringal lignin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.449; 覆盖度=92.901; E 值=2.26e-146; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.421; 覆盖度=99.691; E 值=4.75e-162; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.449; 覆盖度=92.901; E 值=2.26e-146; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.449; 覆盖度=92.901; E 值=2.26e-146; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009531 | secondary cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.273; 覆盖度=95.988; E 值=1.15e-148; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048046 | apoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.449; 覆盖度=92.901; E 值=2.26e-146; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004601 | peroxidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.273; 覆盖度=95.988; E 值=1.15e-148; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0020037 | heme binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.421; 覆盖度=99.691; E 值=4.75e-162; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.421; 覆盖度=99.691; E 值=4.75e-162; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140825 | lactoperoxidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.421; 覆盖度=99.691; E 值=4.75e-162; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G05340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.449; 覆盖度=92.901; E 值=2.26e-146 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G58390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=64.557; 覆盖度=97.531; E 值=2.7e-146 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G58400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.273; 覆盖度=95.988; E 值=1.15e-148 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |