基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G578650 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:145509526-145512616 (-) |
| 描述 | Similar to TYDC3: Tyrosine/DOPA decarboxylase 3 (Papaver somniferum OX%3D3469) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027660 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 0 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g20340 |
双功能酶,催化L-苯丙氨酸脱羧生成2-苯乙胺,然后被氧化形成2-苯乙醛,这是花香成分之一。 | |
At4g28680 |
将酪氨酸转化为酪胺,是异喹啉生物碱和各种酰胺的前体。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0437500 |
参与血清素的生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006520 | amino acid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.323; 覆盖度=85.517; E 值=6.76e-118; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009821 | alkaloid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.694; 覆盖度=85.517; E 值=1.44e-115; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019752 | carboxylic acid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.323; 覆盖度=85.517; E 值=6.76e-118; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042444 | phenylethylamine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.694; 覆盖度=85.517; E 值=1.44e-115; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901695 | tyramine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.694; 覆盖度=85.517; E 值=1.44e-115; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1903184 | L-dopa metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.694; 覆盖度=85.517; E 值=1.44e-115; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.323; 覆盖度=85.517; E 值=6.76e-118; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004837 | tyrosine decarboxylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.323; 覆盖度=85.517; E 值=6.76e-118; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030170 | pyridoxal phosphate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.323; 覆盖度=85.517; E 值=6.76e-118; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0036467 | 5-hydroxy-L-tryptophan decarboxylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.323; 覆盖度=85.517; E 值=6.76e-118; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0036468 | L-dopa decarboxylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.323; 覆盖度=85.517; E 值=6.76e-118; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |