基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G576870 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:145041281-145045686 (-) |
| 描述 | Similar to MRL7: Thioredoxin-like fold domain-containing protein MRL7%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000911 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0829000 |
在叶绿体发育的早期步骤中发挥重要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009266 | response to temperature stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009646 | response to absence of light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.553; 覆盖度=64.793; E 值=9.08e-35; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042644 | chloroplast nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G31840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.553; 覆盖度=64.793; E 值=9.08e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G28590 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=61.745; 覆盖度=88.166; E 值=3.26e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0829000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.238; 覆盖度=74.556; E 值=1.41e-113 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0417200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.629; 覆盖度=57.396; E 值=1.69e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |