基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G548670 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:137819129-137823401 (+) |
| 描述 | Similar to VIT_05s0020g04070: 1%2C2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase 1 (Vitis vinifera OX%3D29760) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_001302 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006555 | methionine metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019509 | L-methionine salvage from methylthioadenosine | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.41; 覆盖度=88.406; E 值=1.38e-101; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.41; 覆盖度=88.406; E 值=1.38e-101; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005506 | iron ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010308 | acireductone dioxygenase (Ni2+-requiring) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010309 | acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016151 | nickel cation binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.717; 覆盖度=88.889; E 值=2.58e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G43850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.41; 覆盖度=88.406; E 值=1.38e-101 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |