基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G542230 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:136025528-136026753 (+) |
| 描述 | Similar to RPL18: 50S ribosomal protein L18%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_001376 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g48350 |
与 5S rRNA 结合，形成 50S 亚基中央突起的一部分。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0828100 |
与 5S rRNA 结合，形成 50S 亚基中央突起的一部分。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=IDA:CAFA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=IDA:CAFA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005840 | ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022625 | cytosolic large ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=65.789; 覆盖度=67.059; E 值=8.59e-48; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008097 | 5S rRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G48350 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.482; 覆盖度=97.647; E 值=4.61e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0828100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.0; 覆盖度=88.235; E 值=1.39e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gka:GK0122 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=65.789; 覆盖度=67.059; E 值=8.59e-48 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |