基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G399810 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:99783881-99787315 (-) |
| 描述 | Similar to Exopolygalacturonase (Fragment) (Oenothera organensis OX%3D3945) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_001837 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g61730 |
在花药发育过程中调节绒毡层退化和花粉成熟。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g36000 |
可能的F-box蛋白At5g36000。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g60600 |
质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶，将2-C-甲基-D-赤藓醇2,4-环二磷酸（ME-2,4cPP）转化为1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基4-二磷酸。 |
CHLOROPLAST BIOGENESIS genes act cell and noncell autonomously in early chloroplast development.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.036996
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0603800 |
质体非甲羟戊酸途径中的异戊二烯类生物合成酶，将2-C-甲基-D-赤藓醇2,4-环二磷酸（ME-2,4cPP）转化为1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基4-二磷酸。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005975 | carbohydrate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.909; 覆盖度=51.793; E 值=7.54e-127; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.909; 覆盖度=51.793; E 值=7.54e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.909; 覆盖度=51.793; E 值=7.54e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004650 | polygalacturonase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.909; 覆盖度=51.793; E 值=7.54e-127; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0047911 | galacturan 1,4-alpha-galacturonidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.909; 覆盖度=51.793; E 值=7.54e-127; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G07850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.543; 覆盖度=54.663; E 值=1.88e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ghi:107942091 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=51.913; 覆盖度=52.511; E 值=7.55e-124 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |