基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G202320 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:51538455-51538870 (+) |
| 描述 | Similar to Os02g0512300: RNA pseudouridine synthase 7 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_031959 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g51140 |
RNA假尿苷合成酶7。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0512300 |
RNA假尿苷合成酶7。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000455 | enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.16; 覆盖度=100.267; E 值=5.8e-180; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.609; 覆盖度=70.933; E 值=1.35e-71; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031119 | tRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.864; 覆盖度=101.867; E 值=9.34e-79; UniProt GO evidence=EXP:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990481 | mRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.609; 覆盖度=70.933; E 值=1.35e-71; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.573; 覆盖度=94.933; E 值=4.03e-171; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.864; 覆盖度=101.867; E 值=9.34e-79; UniProt GO evidence=ISO:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.864; 覆盖度=101.867; E 值=9.34e-79; UniProt GO evidence=HDA:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.16; 覆盖度=100.267; E 值=5.8e-180; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009982 | pseudouridine synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.16; 覆盖度=100.267; E 值=5.8e-180; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0160151 | tRNA pseudouridine(32) synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.864; 覆盖度=101.867; E 值=9.34e-79; UniProt GO evidence=EXP:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G51140 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.573; 覆盖度=94.933; E 值=4.03e-171 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:27079 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.609; 覆盖度=70.933; E 值=1.35e-71 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:271842 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.105; 覆盖度=70.933; E 值=7.35e-71 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | spo:2542607 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.864; 覆盖度=101.867; E 值=9.34e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |