基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G162490 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:41515289-41517700 (-) |
| 描述 | Similar to MTP4: Metal tolerance protein 4 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004359 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g58060 |
参与将多余金属从细胞质隔离到液泡中以维持金属稳态。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g79520 |
参与将多余金属从细胞质隔离到液泡中以维持金属稳态。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0226400 |
参与将多余金属从细胞质隔离到液泡中以维持金属稳态。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0775100 |
参与将多余金属从细胞质隔离到液泡中以维持金属稳态。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0837800 |
参与将多余金属从细胞质隔离到液泡中以维持金属稳态。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006826 | iron ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009845 | seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048316 | seed development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071421 | manganese ion transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005774 | vacuolar membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.869; 覆盖度=94.554; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009705 | plant-type vacuole membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.869; 覆盖度=94.554; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035618 | root hair | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005384 | manganese ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.869; 覆盖度=94.554; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008324 | monoatomic cation transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.402; 覆盖度=81.188; E 值=6.8e-120; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010486 | manganese:proton antiporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.501; 覆盖度=88.366; E 值=8.09e-120; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G79520 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=56.402; 覆盖度=81.188; E 值=6.8e-120 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G58060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.833; 覆盖度=95.05; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0837800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.501; 覆盖度=88.366; E 值=8.09e-120 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0775100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=69.674; 覆盖度=98.762; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0226400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.869; 覆盖度=94.554; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |