基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G129770 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:32770849-32772422 (-) |
| 描述 | Similar to ytqB: Putative rRNA methylase YtqB (Bacillus subtilis (strain 168) OX%3D224308) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_004638 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g16445 |
参与在tRNA摇摆位点（U34）合成5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷（mnm(5)s(2)U）。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0511700 |
参与在tRNA摇摆位点（U34）合成5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷（mnm(5)s(2)U）。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0008033 | tRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.54; 覆盖度=81.724; E 值=5.8e-93; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032259 | methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.54; 覆盖度=81.724; E 值=5.8e-93; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.54; 覆盖度=81.724; E 值=5.8e-93; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.54; 覆盖度=81.724; E 值=5.8e-93; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004808 | tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)(34)-methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.54; 覆盖度=81.724; E 值=5.8e-93; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G16445 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.54; 覆盖度=81.724; E 值=5.8e-93 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU30490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=67.241; E 值=1.65e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0511700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.488; 覆盖度=71.379; E 值=1.04e-85 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sao:SAOUHSC_01878 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.095; 覆盖度=58.276; E 值=2.83e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |