基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G109920 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:27918148-27919847 (+) |
| 描述 | Similar to ZMYM5: Zinc finger MYM-type protein 5 (Homo sapiens OX%3D9606) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000999 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g01120 |
有助于角质层蜡和木栓质的生物合成。 |
KCS1 encodes a fatty acid elongase 3-ketoacyl-CoA synthase affecting wax biosynthesis in Arabidopsis thaliana.1999 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1999.00352.x
|
At2g26640 |
对饱和和单不饱和酰基链 C16 至 C20 均具有活性。 | |
At1g04220 |
介导从22到26个碳长度(如C22、C24、C26)超长链脂肪酸(VLCFAs)的合成。 |
Specific and differential inhibition of very-long-chain fatty acid elongases from Arabidopsis thaliana by different herbicides.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0404600101
|
At5g43760 |
介导从22到26个碳长度(如C22、C24、C26)超长链脂肪酸(VLCFAs)的合成。 | |
At2g16280 |
参与C22至C24脂肪酸的延长;这些脂肪酸是角质层蜡、脂肪族木栓质及包括鞘脂和磷脂在内的膜脂的生物合成前体。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000122 | negative regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.744; 覆盖度=22.78; E 值=2.86e-14; UniProt GO evidence=IDA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.744; 覆盖度=22.78; E 值=2.86e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.744; 覆盖度=22.78; E 值=2.86e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.744; 覆盖度=22.78; E 值=2.86e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046983 | protein dimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.524; 覆盖度=33.411; E 值=1.84e-06; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | bta:536389 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.0; 覆盖度=11.682; E 值=1.88e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:79830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.524; 覆盖度=33.411; E 值=1.84e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:9205 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.744; 覆盖度=22.78; E 值=2.86e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mcf:101867372 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=30.964; 覆盖度=23.014; E 值=1.14e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:219105 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.374; 覆盖度=11.565; E 值=7.03e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |