基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G024020 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:6193858-6194603 (+) |
| 描述 | Similar to AOP1.2: Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase AOP1.2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005676 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: Q945B6 |
可能的2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶,可能参与硫代葡萄糖苷生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q944Z5 |
可能的2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶,可能参与硫代葡萄糖苷生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g03070 |
可能的2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶,可能参与硫代葡萄糖苷生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g80330 |
将无活性的赤霉素 前体 GA9 和 GA20 转化为生物活性赤霉素 GA4 和 GA1。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.658; 覆盖度=93.713; E 值=5.33e-72; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009699 | phenylpropanoid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.658; 覆盖度=93.713; E 值=5.33e-72; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019761 | glucosinolate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.6; 覆盖度=74.85; E 值=4.87e-37; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.175; 覆盖度=94.311; E 值=3.35e-88; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016706 | 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.175; 覆盖度=94.311; E 值=3.35e-88; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.631; 覆盖度=94.012; E 值=3.94e-90; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051213 | dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.631; 覆盖度=94.012; E 值=3.94e-90; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ag:ALG05135 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.658; 覆盖度=93.713; E 值=5.33e-72 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G03070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.175; 覆盖度=94.311; E 值=3.35e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |