基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G023850 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:6128861-6149682 (-) |
| 描述 | Similar to ASI1: Protein ANTI-SILENCING 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_005683 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g11470 |
可能参与 RNA 加工、聚腺苷酸化及表观遗传沉默的调控。 |
Mechanism for full-length RNA processing of Arabidopsis genes containing intragenic heterochromatin.2013 · DOI: 10.1038/ncomms3301 RNA-binding protein regulates plant DNA methylation by controlling mRNA processing at the intronic heterochromatin-containing gene IBM1.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1315399110 A protein complex regulates RNA processing of intronic heterochromatin-containing genes in Arabidopsis .2017 · DOI: 10.1073/pnas.1710683114
|
At3g51290 |
参与根尖细胞分化与细胞伸长的协调。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g60320 |
硝酸盐信号传导所需。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0562700 |
参与叶形状形成的调节。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031507 | heterochromatin formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0040029 | epigenetic regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080188 | gene silencing by siRNA-directed DNA methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0141005 | transposable element silencing by heterochromatin formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032991 | protein-containing complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003682 | chromatin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G11470 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.065; 覆盖度=22.857; E 值=9.7e-50 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |