基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G019520 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:5022356-5024791 (-) |
| 描述 | Similar to RHA4A: Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHA4A (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_005738 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g24015 |
可能的 E3 泛素蛋白连接酶，在体外可能具有 E3 泛素连接酶活性。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g33480 |
RING-H2 指状蛋白 ATL58。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g10150 |
RING-H2 指蛋白 ATL7。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g10160 |
E3泛素蛋白连接酶，能够在体外通过与泛素结合酶 E2 UBC8、UBC10、UBC11 和 UBC34 的作用催化多泛素化。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g46650 |
RING-H2 指蛋白 ATL30。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.131; 覆盖度=68.304; E 值=1.12e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.131; 覆盖度=68.304; E 值=1.12e-45; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.911; 覆盖度=70.536; E 值=1.32e-22; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.374; 覆盖度=88.393; E 值=8.15e-32; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.131; 覆盖度=68.304; E 值=1.12e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.911; 覆盖度=70.536; E 值=1.32e-22; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.131; 覆盖度=68.304; E 值=1.12e-45; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.131; 覆盖度=68.304; E 值=1.12e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G23980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.0; 覆盖度=62.5; E 值=1.56e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G33480 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.374; 覆盖度=88.393; E 值=8.15e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G10150 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.0; 覆盖度=66.964; E 值=1.33e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G10160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.911; 覆盖度=70.536; E 值=1.32e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G24015 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.131; 覆盖度=68.304; E 值=1.12e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |